我們來談談，什麼叫理論。理論是對未知的一種推測。但是理論永遠是理論，不管怎麼被證實，理論不會變成真理。但何謂真理？要用眼睛看到才叫真理？要用身體感受到才叫真理？要摸到才叫真理？我們讀的理論越多，會發現人類只能接近真理，無法知道真正的真理。所以，真理是一個聖杯，而聖杯是否存在根本沒人知道。
要了解這樣的概念，要先從量子物理談起。談中醫談到量子物理，會不會太荒謬？沒關係，聽的越久，你會覺得越來越合理。量子物理開始於人類研究原子尺度的物理。當時的人類還沒有技術看到原子長什麼樣子，所以都是透過實驗”間接”推論出原子的長相。我們把比較主要的拿出來談談。
最早的原子理論就是John Dalton提出，Dalton的理論只認為原子是不可分的最小物質。至於原子長什麼樣子，Dalton沒有意見。這個理論可以解釋一些問題，但相對的也無法解釋另一些問題。如果我們活在那個時代，我們要告訴自己，理論方向是對的，有指引出接近真理的方向，但還不夠接近真理。這就是科學，理性的相信當下最合理的東西，就算他是錯的，至少不是全部都錯！反正之後會再修正。科學家就是這樣的東西，想辨法提出很多解釋，然後再驗證，再解釋，再驗證。至於能對多少，只能努力，不能強求。
接下來是Sir Joseph John Thomson，他提出梅子布丁模型。維基百科上抓下來的，長這樣
因為Thomson研究陰極射線，發現陰極射線就是現在所說的電子，也就是說，Dalton所說的不可分割的原子，其實還可以被分出電子這樣的小單位。他打破了Dalton的"原子是不可分的最小物質"這個說法。既然如此，Dalton的原子理論就要被修正，Thomson提出了新的原子模型，一個很大的正電圓布丁，上面放很多像梅子一樣的負電子以維持原子是電中性的。
接下來Ernest Rutherford提出了另一個模型，這個時候是１９１１年，１９１１年是什麼年呢？剛好滿清倒下，民國成立。總是對這種時代差異感到驚訝。中國人還在纏小腳和綁辮子，西方世界卻在做原子實驗。
Rutherford怎麼會提出這樣的模型呢？因為他做了一實驗，大家可以從１分２秒開始看。
中間黃色的部份是金箔，製造的很薄很薄，說多薄就有多薄。然後用α 粒子去射擊金箔。α 粒子就好像是子彈，一直射著金箔。大部份的粒子都會射穿金箔然後打在後方的屏幕，屏幕渡上了一層硫化鋅，只要α 粒子打在上面就會發出火光。我們每每設計一個實驗，都要”預期”。預期什麼？預期一個結果，這樣做實驗才會心理有數。如果你不預期結果，做錯的時候怎麼知道自己錯了？所以預期結果是做實驗很重要的觀念。Rutherford基於梅子布丁模型（請注意，這只是一個理論），他預期多數的”子彈”當然會穿過金箔。所以後面的屏幕就只要圍住前半部就好了。但是，很多事都是有萬一的，尤其是你基於"理論"做的推斷。這就是科學精神。Rutherford不想遺漏了其它不確定的東西，就叫他的學生把屏幕放在其它角度看看。當屏幕放在金箔的前方時，本來”預期”是不會看到亮點的，偏偏，偏偏，偏偏，偏偏就看到亮點了。與預期不符，所以他的學生開始檢查實驗的細節，是不是那裡錯了。查來查去，確定都沒有問題，那就是要相信結果。但是選擇相信結果就是承認梅子布丁模型錯了。當我們要去否認一個領域中大家都認同的東西時，那是需要勇氣的。Rutherford經過推理驗證，最後提出了新的原子模型，如下
這就是現在大家所熟析的原子的樣子。
請大家注意，事情發展到這個樣子，即使是現代人，已經是２１世紀，多數人還是認為原子長這樣子。但是，有人真得看到原子的樣子嗎？真得長這樣嗎？如果都沒人真的看過，有誰敢說這是真的？最多只能說，長這個樣子的原子，可以合理解釋Rutherford的實驗結果。
但這個原子模型有致命的缺點，以電磁學理論來說，電子繞原子核轉，會發出電磁波，沒多久就會偏離軌道然後跟原子核撞在一起。這樣的原子是無法建構這個世界的。
時間進入1913年，Bohr引進了量化的觀念，由於能量是不連續的性質，是一個小單位小單位發出的。所以電子不會任意的發出電磁波，必需要一次發出一個單位的電磁波。也就是說，如果電子無法一次發出一個單位的電磁波出來，就只能乖乖的在固定的軌道上繞行原子核。這告訴大家，其實電子是在固定的軌道上轉的。如下
附帶一提 Bohr 被封為爵士時，自已設計的太極徽章，如下。大象是印度的，太極是中國的，徽章是英國的。有一些趣味…。
接下來的發展越來越詭異了。
1924年，Louis Victor de Broglie，提出了波動說，以波來描述物質的實體(這是佛教的虛空嗎？)。在當時這想法太過先進。連de Broglie的老師都不知道該怎麼辨。驚動了不少人。我們先說明，De Broglie本來是學歷史與文學的。轉學理科會有這樣的成就，完全是因為讀歷史深入的人，會有一種看破表像的能力。學歷史的人只要常常問自己，我們所看到的歷史是否為真？還是只是一個羅生門的翻版？歷史是一個一個的故事，你說的故事跟我說的故事可能都是同一件事，但為什麼說出來結論不同？還是歷史只是每一個人在說自己的故事！連近代台灣的228還有許多的見證者，都很難知道真實是什麼！何況是一百年，幾百年，甚至是千年以上的歷史？所有的故事，所有的事件都是人紀錄下來，但人值得相信嗎？表象的底面是什麼？歷史的表象又是什麼？我們可以看到許多學歷史的人，守著一個觀點，一個角度的看法，不斷的闡述個人認為的真實。封閉在歷史洪流中，這不可取。我們學歷史的意義是什麼？就是要像de Broglie，看破事物的表象。
過了兩年，1926年，Schrödinger 利用這個物質波的觀念，找到了波動方程式來描述原子模型。結果，電子變成一種機率的分佈了，如下，
圖中周圍的黑點就是一個一個的電子，最黑的一圈可以解釋為電子繞行原子核的軌道，我們稱所有的電子點為電子雲。這個雲其實是個機率的分佈，也就是說，如果我們想要抓到電子，越黑的地方抓到的機會越大。在我們去抓電子前，電子是如圖上的黑點分佈在原子核周圍。真實的位置在那裡我們是不會知道的。
這個聽起來會不會很詭異，真實的位置在那裡我們不會知道！這個模型聽起來最不能讓人接受，什麼叫電子是分佈的？但他卻是最接近真理的解釋。理性就是要接受我們認為不可能，但卻合理的事物。人們所謂的可能，往往是經驗法則與一相情願的看法。科學一直在處理的就是這樣的現象。
一直到現在，我們真得看到原子的樣子了嗎？如果還沒看到，未來是不是還會有新的原子模型？如果還會有新的原子模型，那我們要用什麼心態去接受它？
想清楚這樣的心態，我們就能了解，所謂的理論，只能接近真理，卻不是真理！所謂的理論，只要能在某個程度正確的描述自然，就可以被接受。就好比愛因斯坦相對論。太過先進，而不能被當時的人們接受。因為當時的政治與環境產生了人的偏見。但相對論終究是一個理論，不是真理。相對論基於兩個公設：
一，所有運動都是相對的。
二，光速不變。
以這兩個公設推論出來的世界，是對的嗎？是真理嗎？誰規定所有運動一定是相對的呢？又誰規定光速不變？但我們接受了這個理論，因為它解釋了許多的物理現象。萬一有一天，有人提出了另一個理論，也可以解釋這些現象，我們又得重新思考相對論所代表的意義是什麼。所以，愛因斯坦得諾貝爾獎從來都不是因為相對論，而是因為光電效應。光電效應是一種現象，一種真實的存在，所以可以得獎。而理論永遠只是個理論。
了解科學對理論的哲學是什麼後，我們就可以檢視中醫的理論科不科學、驗證中醫理論是否能治病和了解中醫理論有多接近真理。如果你相信上面這些原子的模型的話。要接受中醫理論就不會太難。
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